C’est une expression souvent utilisée pour les débutants dans un métier.
"C’est le métier qui rentre". Ici on parle implicitement de "rentrer" dans la tête, dans le savoir, les connaissances, dans les habitudes.
C'est acquérir de l'expérience dans son métier en faisant des erreurs.
Exemple d'un menuiser (personne travaillant le bois)
Il se donne un coup de marteau (outil lourd pour enfoncer des clous) sur les doigts. Il a mal bien sûr!
Là, on lui dit cette expression. Cela signifie que cela va lui arriver souvent dans son métier. Que cela arrive à tout le monde débutant dans ce métier. Il va s'habituer et s'améliorer.