求助！分子生物学小考的题目不知道怎么答，求前辈指导！

雅歌

你哪个年级。这应该是大一的题？
不是每个gène 都有两个allèle么
但是ADNc不是人身上的东西吧

luoluociol

我理解的意思是，你目前手头上有一个正在研究中的蛋白质的cDNA, 这里就给出一个信息，你已经获得了mRNA并且通过Rtpcr 获得了cDNA，这个时候你要搞清楚cdna 代表的是表达这个蛋白的所有有小片段 normalement c‘est exon.
而这个时候他给你的研究任务是研究这个蛋白在肝脏里是否有表达，且code 这个蛋白的 gene 有多少种表达形式，一般 adn genomique code 很多种蛋白的。这个时候因为你有cadn所以你可以根据这个设计不同的primer就是amorce 比如说开头的 结尾的 中间的，等等，然后从肝脏细胞中提取 soit dna, soit rna 然后各种pcr 这里你就用自己所知道的各种yy就好了还可以就理论上预测你可能会得到的结果，反正这种题你只要把涉及的基础概念写清楚之后就是以此为基础的yy。

雅歌

luoluociol 发表于 2012-11-27 18:29
我理解的意思是，你目前手头上有一个正在研究中的蛋白质的cDNA, 这里就给出一个信息，你已经获得了mRNA并且 ...

cDNA都有了，都知道啥基因了，pubmed一下不就知道在肝里面表达不表达了。。。
另外如果是ARNm，也不是combien de copies de gène啊，gène不就是指DNA
擦，我知道的太多了

luoluociol

gène 不等于DNA 而是dna 的可遗传的有效序列片段，。而且这题应该是本科的题，我觉得是为了启发研究的思路。pubmed也不是万能的，如果这个蛋白主要是在大脑里表达，肝脏里没有人研究过呢？虽然combien de copie gène这里没怎么看懂。会不会是指 modification post transcriptionelle?

雅歌

luoluociol 发表于 2012-11-28 15:17
gène 不等于DNA 而是dna 的可遗传的有效序列片段，。而且这题应该是本科的题，我觉得是为了启发研究的思路 ...

对，我也是因为这个combien de copie觉得题目出得不明白。

Skygenie

luoluociol 发表于 2012-11-27 18:29
我理解的意思是，你目前手头上有一个正在研究中的蛋白质的cDNA, 这里就给出一个信息，你已经获得了mRNA并且 ...

“je cherche à savoir si le gène codant cette protéine est présent dans le foie et combien de copies de ce gène sont présentes”貌似人家完全没有想问蛋白质的表达情况，只是在问这个基因是否存在于肝脏和有多少个复制而已。不要误导无辜群众嘛。。。

Skygenie

雅歌 发表于 2012-11-26 19:39
你哪个年级。这应该是大一的题？
不是每个gène 都有两个allèle么
但是ADNc不是人身上的东西吧 ...

ADNc是人工合成的AND complementaire du mRNA，它本身就不是任何生物身上的。

Skygenie

wheatone 发表于 2012-12-8 22:02
PCR quantitative

PCR quantitative 测得是mRNA的表达情况，跟chromosome本身没有关系。

Skygenie

我觉得既然人类的全部基因序列已经被测出来，那先把手头上的cDNA测序，然后直接 in silico 跟人类基因序列对比就行了，这样既可以知道这个基因是否存在于人体细胞，又可以知道它在每个细胞中有多少个copies。如果楼主引用的法语就是原文的话，个人感觉“foie”在这里只是一个幌子，因为只看DNA序列的话，一个人全身的cellules parenchymales都一个脸。

雅歌

Skygenie 发表于 2012-12-15 04:58
我觉得既然人类的全部基因序列已经被测出来，那先把手头上的cDNA测序，然后直接 in silico 跟人类基因序列 ...

一个基因在每个细胞中都是两个allele，也就是两个copies，否则位于genome不同的位点的相似基因一般会叫基因1和基因2，不会有人说某基因有四个copies。一个基因怎么可能不présente在每个细胞中呢，除非红细胞这种。如果是RNA就不能称之为基因的copie了。

我学生物也9年了，这题本身出的不明不白的，或者楼主复述有问题。如果真是问基因的copie，感觉应该是一二年级的东西，跟什么cDNA也没关系。问mRNA的表达才有点意思。

Skygenie

雅歌 发表于 2012-12-15 09:49
一个基因在每个细胞中都是两个allele，也就是两个copies，否则位于genome不同的位点的相似基因一般会叫基 ...

这个不是allele的问题，题目说的copie数是指该基因序列在基因组中重复出现的次数。真核生物的基因常常成多拷贝，尤其是履行基本功能的gene de menage，在基因组中有好几十好几百都不足为奇，比如编码核糖体组成蛋白的那些，组蛋白的那些。

如果原题目不是要求设计实验的话，去NCBI或者是EBI来个BLAST就行。

否则就是原题表达不准，想问ARNm的表达量，那个就去搞qPCR，但是ARNm不会说copie数的。

Skygenie

雅歌 发表于 2012-12-15 09:49
一个基因在每个细胞中都是两个allele，也就是两个copies，否则位于genome不同的位点的相似基因一般会叫基 ...

原题没说这个cADN来自人体细胞，在科研中我们经常会遇到需要知道一种特殊的基因是否在另一个生物体内表达与否的情况。所以也不是特别怪的题，也许表达的不够细致吧。
另外一个基因可以说在一个基因组里有几个copies。

雅歌

Skygenie 发表于 2012-12-15 18:03
这个不是allele的问题，题目说的copie数是指该基因序列在基因组中重复出现的次数。真核生物的基因常常成 ...

这些基因都叫一个名字么，我的理解是就算是同一功能的，只要是两个位点，至少会用阿拉伯数字来区别，gene1，gene2，gene3吧，我理解这就是不同的基因，只是大家在一个family里面

比如
Super family         Family         Subfamily         Members

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H1F        
H1F0, H1FNT, H1FOO, H1FX


拷贝数可能在进化里面这么叫，但是功能研究中应该不大可能把所有family的基因叫做同一拷贝